제2차 장애인복지발전 5개년 계획(2003~2007)에 의해 재활치료 활성화 및 전국의 장애인이 이용할 수 있는 국립재활원 수준의 권역별 재활종합병원 설립 추진계획이 수립되었다.

권역별재활병원 건립사업은 경인, 강원, 대전, 영남, 호남, 제주의 6개 권역에 150병상 이상의 재활병원을 건립하는 사업이고, 이를 위하여 총 1,720억원의 예산이 투입되었다.

이는 재활의료 서비스 향상을 통해 장애관련 의료 인력의 수도권 집중현상으로 지방 거주 장애인이 양질의 의료서비스를 이용하는데 불펴을 겪지 않도록 하기 위한 목적도 있었다.

또한 척수손상, 뇌졸중 등 중도장애의 경우 아급성기와 만성기(유지기)를 위한 재활치료는 병원입장에서는 수익이 되지 않는, 꺼려하는 분야여서 공공의료를 위한 공공성 확보를 위한 포석의 의미도 있었다.

2010년 경인의료재활센터, 2011년 영남권역재활병원이 개원한 데 이어, 호남권역재활병원, 강원도재활병원, 대전충청권역의료재활센터가 2012년 말까지 개원하였고, 2013년 마지막으로 제주권역별재활병원이 개원하였다